二届四中全会从2月2日到7日，共开了6天时间。除通过了一系列整理党务的议案以外，还改组了国民党中央机构和国民政府。蒋介石、谭延闿、宋庆龄、于右任、程潜、朱培德、宋子文、柏文蔚、何香凝、伍朝枢、丁惟汾、戴季陶、李济深、甘乃光、陈友仁、李烈钧、王法勤、萧佛成、王乐平、丁超五、何应钦、褚民谊、陈肇英、陈嘉祜、周启刚、刘守中、黄实、朱霁青、经亨颐、白云梯、恩克巴图等人当选为中央执行委员。胡汉民、孙科、伍朝枢，以及汪精卫和汪派主要骨干顾孟余、陈公博、陈友仁、甘乃光等虽不在会上，也依旧得以入选新的中央执行委员会。会议并推蒋介石、谭延闿、于右任、戴季陶、丁惟汾5人为中央执行委员会常务委员。会议同时还通过了《改组国民政府案》和《中华民国国民政府组织法》，明确规定：“国民政府受中国国民党中央执行委员会之指导及监督，掌理全国政务。”国民政府实行主席制，国民政府委员由国民党中央执行委员会推举委员若干人组织之，并推定其中5至7人为常务委员，于常委中推定1人为主席。会议还通过了《国民政府军事委员会组织大纲》《国民革命军总司令部组织大纲》等，规定“军事委员会为国民政府军政最高机关”，“特任国民革命军总司令一人，凡属于国民革命军之陆、海、空各军，均归其节制指挥”，“总司令得兼任军事委员会主席”。据此，会议推选丁惟汾等49人为国民政府委员，指定谭延闿、张静江、李烈钧、于右任、蔡元培5人为国民政府常务委员，以谭延闿为主席。会议并推选于右任等73人为军事委员会委员，指定于右任、白崇禧、李宗仁、李济深、何应钦、阎锡山、谭延闿等12人为常务委员，以蒋介石为主席。