同普通的恋人一样，他们争吵、和解，再争吵、再和解。有时，玛丽的勃然大怒弄得他心灰意冷。1841年元旦，他们再次大吵大闹之后分手——这一次好像要永远分手了。几个星期后，林肯在给他的伙伴约翰·托德·斯图亚特的信中写道：“我现在是世上最悲惨的人。如果把我的痛苦平分给全人类，世上将连一张笑脸也没有了。很难说我会不会好转……我无法再这样活下去；在我看来，要么好转，要么死去。”
分手后的这段时间，林肯简直有些神经错乱了。他能一个星期不出屋门，他的体重大大减轻了，连大声说话的气力也没有了。于是，他想到了自杀。他感到除了对玛丽的感情之外——既忘不掉她，又娶不了她——在这个世界上他还没有做过任何值得回忆的事情。
分手一年后的一天，林肯和玛丽又在街头邂逅了。他们再次开始互相拜访，不过这一次是秘密的。11月的一天早晨，林肯敲开了朋友的房门，告诉他的朋友，他这天晚上同玛丽·托德结婚。
终于和心爱的人结婚了，但是结婚并不是两个人的简单结合，在婚姻的最初，他们也经历了艰难的磨合时期，他们时有争吵。有一次，邻居发现玛丽手中握着一把刀子把丈夫赶出了家门。那是一个星期天的早晨，到教堂作祈祷的人们正从街上走过，他们看到林肯逼着玛丽退回厨房，他一边喊叫着：“有话屋里讲，别让我们在大庭广众面前丢人现眼！”还有一次，林肯追赶着玛丽绕街区跑过，一边喊叫着：“你把这个家闹得简直没有办法过下去了，你给我滚！”