李渊见他这样，仍然是怒气不解。当夜，把李建成安置在幕下，只给他麦饭吃，又派殿中监陈福监守住他，任何人不能靠近。
李渊做完这些事，派遣司农卿宇文颖驰召杨文幹来觐见。
宇文颖到了庆州，马上背叛李渊，告诉杨文幹实情。
杨文幹当即举兵造反。
李渊听了，马上派遣左武卫将军钱九陇与灵州都督杨师道攻打杨文幹。
之后，他把秦王李世民叫了过去，商讨对策。
李世民说：“文幹竖子，敢为狂逆，计府僚已应擒戮；若不尔，正应遣一将讨之耳。”
李渊说：“不然。杨文幹事连太子建成，恐怕响应的人多。你应当率兵去攻打，回来之后，我立你为太子。我不能效隋文帝诛他的儿子，封建成为蜀王。蜀兵脆弱，它日苟能事你，你要保全他；不能事你，你取他也容易。”
李渊住在仁智宫，怕有人盗兵猝发，当夜，帅宿卫南出山外，行数十里，东宫官属将卒有追上来的，令他们三十人为一队，分兵围守他们。第二天，李渊才回仁智宫。