章太炎在台湾居住半年，救国之念不息，准备返里。馆森鸿以为“政变以来，法网綦严，若不戒陷阱，虽糜顶踵何益，因劝东游”[7]，馆森鸿也乞假四日。这样，章太炎在馆森鸿的陪同下，于1899年6月10日“发基隆”，14日“步上神户”，17日“发大名趋名古屋”，游览名胜古迹，阅赏寺院藏品，写《游西京记》以记其事[8]。
1899年8、9月间（七月下旬），章氏由日返国，往来沪浙，为《亚东时报》《五洲时事汇编》撰文，和唐才常等人游，并将《訄书》付梓。
冬12月，馆森鸿由台湾经广东、福建来上海，“首访章太炎”，他们“海上重晤，握手感喜”，章并赋七律一章以赠[9]。接着，馆森又游苏州，访章氏之师俞樾，“问近日著作？”俞樾谦逊地说：“所著之书，皆是迂疏无用之学，刻成四百七十余卷，虽已流传人间，实不足言学问，今老矣，无所添益。”[10]