新中国成立后，此时在武汉华中大学任教的钱基博像许许多多爱国的知识分子一样，为祖国的大一统和国际地位的提高而欢欣鼓舞，倍感骄傲。1950年，老人决定将自己生平积累的028几十箱珍贵藏书，全部赠予华中大学图书馆。1951年10月29日，《毛泽东选集》（第一卷）甫一出版，已是六十五岁的老先生就急切购来，并花费了十天工夫通读全书。到了1952年6月，“思想改造运动”开始。面对过去，要求进步的钱基博，也是像大大小小的旧知识分子一样，真诚地改造检讨，并痛下针砭，写下两万多字自我作践的“自我检讨书”一份，这才侥幸过关。此年，武汉华中师范学院成立，钱基博转任历史系教授，为了改善历史系教学设备，老先生又将平生所藏两百一十二件文物古玩悉数捐赠出来，帮助筹建历史博物馆。
这部年谱最有价值的、能留存后世的，也就是附加披露了老先生所写的两万多字“自我检讨书”，检讨书分四个部分：一、我的思想，多方面接受，不过不放弃我中国人的立场。
二、我的社会意识很浓厚，而革命性则缺乏。三、我不能劳动，而人家劳动的果实，则不敢糟蹋。四、我不愿自己腐化以腐化社会，尤其不愿接受社会腐化以腐蚀我民族本能。在这份检讨书里，钱基博虽说将自己堂堂正正的一生作了简要介绍，但也没少作践和糟蹋自己，“开场白”就是：“思想改造，当得自动，不能被动；不过人类通病，自尿不觉臭，旁观者清。”他骂胡适：“主张全盘接受欧化，他的考古学，也是自己打自己嘴巴，一味替洋人吹。”他自我剖析：“自私自利、029自高自大的行为虽尽力避免，而自私自利、自高自大的观念，并未根除净尽。”他把发展中的祖国称为“神蛇”，并说：“时时考虑我这个人，对社会有没有用，如果没有用，我决不以老废细胞，妨碍神蛇的发展，做绊脚石。我愿为社会服务，我不愿社会姑息我，倘社会认我不合时代需要，应得予清除。”到了“反右”运动的1957年，甫一开始，刚正耿直的钱老先生作为一名政协委员，又开始“鸣放”他自认为是披肝沥胆的忠直之言了。他给湖北省领导上了一封洋洋洒洒的“万言书”，指出省领导工作中的某些缺点。他这边还自以为是向党交心输诚呢，兴致勃勃地赋诗吟诵：“白头忧国输忠悃，青简明经指要津”；没想到那边就展开针对他的革命大批判了，一个读书人的尊严彻底沦丧殆尽。已是风烛残年的钱基博遭此变故，经不住这场明珠暗投的屈辱，结果一病不起，郁郁而终，时年七十一岁。钱基博至死，也没有给戴上“右派分子”的头衔，但他的孪生兄弟、历任江苏省政协副主席、苏南行署副主任、省民建副主席、省工商联主委等职的钱基厚（字孙卿），却难逃厄运，被划为“右派”，撤销了一切职务。他的那篇也是糟蹋自己、痛骂自己并彻底交代“罪行”和彻底悔过的“发言稿”，被要求刊登在这年7月间的《人民日报》上，标题就是《我做了人民的罪人》。到了“文革”期间，钱基厚又被定性为030“反革命分子”，于1975年含冤去世。其间，钱基厚遗留有五百余册、经历数十寒暑的《潜庐日记》，在遭到红卫兵的查抄批判后，也被付之一炬、化为尘烟。