在建有主教教堂和修道院附属教堂的城市中，也有许多教会人员，如大主教、主教、神甫、修士和修女等混杂在城市居民中。他们属于受保护的城市居民上层，但并非城市市民。他们只遵守教会法规，也只受大都不在同一城市设立的教会法庭的审讯，不受市政当局的管辖，也不受城市经济法规的约束，不向城市缴纳赋税，但其经营活动却经常使城市工商业者感受到激烈的竞争。因此，对于教会和神职人员，无论城市工商业者还是市政当局，都有加以限制的愿望。通过抗争，不少城市也获得了推举本市市民担任教士的权力，并且掌握了对教会财产的管理权。女修道院也只接受本市的单身女子，其产业由市政会委派专人监管。但在反对教士的管辖权（Privilegium fori）和免税权（Privilegium immunitatis）斗争方面，许多城市只是在宗教改革运动兴起后，才有机会获得成功。